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C-value からゲノムサイズへ変換するための式を,wikipedia に見つけました。

the mean weight of one nucleotide pair would be 1.0855× 1e-9 pg, and 1 pg of DNA would represent 0.921 × 1e+9 base pairs.(http://en.wikipedia.org/wiki/C-value)

genome size (bp) = (0.921 x 1e+9) x DNA content (pg)(http://en.wikipedia.org/wiki/C-value)

この式ですが,二倍体生物については,下記のような式だと思います。

(haploid) genome size (bp) = (0.921 x 1e+9) x DNA content (pg) / 2

diploid genome size (bp) = (0.921 x 1e+9) x DNA content (pg)

Wikipedia によると,ヒトの女性の C-value は,6.950 pg だそうです。

diploid human female and male nuclei in G1 phase of the cell cycle should contain 6.950 and 6.829 pg of DNA, respectively.(http://en.wikipedia.org/wiki/C-value)

このデータを上式に代入すると,

haploid genome size (bp) = (0.921 x 1e+9) x 6.950 / 2 = 3.2 Gbp

となり,推定値としては悪くない結果になります。

・・・と,素人なりに頑張って考えてみたのですが,上のような考え方で間違っていないでしょうか? 詳しい方がいましたら,教えていただけると嬉しいです。

質問日 Dec 24 '10 at 04:38

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hacchy
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質問日: Dec 24 '10 at 04:38

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最終更新日: Dec 24 '10 at 04:38

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