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DDBJでは native vendor fileから 画像を落とした 標準形 SRAはあまりかさばるので intensityを落としたSRA-liteでミラーしてます。

質問日 Feb 25 '11 at 15:13

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okubo
1312913

edited Feb 25 '11 at 22:24

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ma_ko ♦♦
3711312


DRAではFASTQ形式をサポートしております。特徴は下記を御参照ください。

ファイル形式 on ftp server
FASTQ形式SRA-Lite形式SRA形式
DRA
ERA※※※
SRA
総サイズ(※) 49TB95TB171TB
総サイズ比率(※)0.29 0.56 1
特徴配列とQuality Scoreのみ SRAの軽量版 会社独自シーケンサ生出力形式に変換可
圧縮外部(※※) 内部 内部
欠点--- 取扱に専用ツール(sra toolkit)が必要 取扱に専用ツール(sra toolkit)が必要
ファイルサイズ大

※2011.2.25時点(調査源:FASTQ:DRA, SRA-Lite,SRA:SRA)
※※DRAではbz2圧縮のFASTQファイルを提供
※※※karツール(sra toolkit)展開後の個別ファイル(アーカイブ無)なら有

回答日 Feb 25 '11 at 15:49

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Eli Kaminuma ♦♦
106114

edited Feb 25 '11 at 17:47

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質問日: Feb 25 '11 at 15:13

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最終更新日: Feb 25 '11 at 22:24

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