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皆様こんにちは

consedでnewblerの出力データに対し,add newしたいのですが、 エラー番号512というのが出てしまい、うまくいきません。 どうしたらいいでしょうか。

tt

質問日 Jun 17 '11 at 16:40

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tt
162

edited Jul 12 '11 at 17:46

consedのテストデータでは問題なく動作しています。

(Jun 17 '11 at 19:14) tt tt's gravatar image

一度コンセンサスをマルチファスタに書き出してから、fasta2Aceをしてもうまくいっておりません。

(Jun 17 '11 at 19:19) tt tt's gravatar image

つまらないことですが、上位のフォルダ名に()がみつかったので除去したら正常に動くようになりました。 お騒がせしました。

回答日 Jul 12 '11 at 17:49

tt's gravatar image

tt
162

consed19で似たような症状が出ているのがSeqAnswersに出ていました。 入力シーケンス名に空白が含まれている場合は修正するか、もしくは最新版のconsed20を試されてみるのはどうでしょう。

回答日 Jun 17 '11 at 23:59

mya_'s gravatar image

mya_ ♦
3881914

edited Jun 18 '11 at 00:06

どうもありがとうございます。他にも例があることがわかり、少し安心しました。サーバーを変えてやってみたらふつうにできました。両方ともconsed20ですが何が違うのかまでは、よくわかりませんでした。

(Jul 06 '11 at 23:52) tt tt's gravatar image
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質問日: Jun 17 '11 at 16:40

閲覧数: 1,928 回

最終更新日: Jul 12 '11 at 17:49

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