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SRAやDRAへの登録エントリー情報などで、明らかな間違いを見つけた場合、 どこかに訂正依頼を連絡した方が良いのでしょうか。

直接NCBIやDDBJに聞け!と言われそうな気もしますが、 同じように間違いを見つけて「まぁ、いいか」と してしまう場合も多そうな気がしたので、 敢えてこちらで質問させていただきました。

※一応SRA handbookで"correction"を探してみましたが特に記載はありませんでした。

一例として、こちらにも詳細を記載していますが、

SRA012435 UCSD-CpgMIP-targeted-bisulfite-sequencing-paired

DRA Search http://trace.ddbj.nig.ac.jp/DRASearch/study?acc=SRP002280

NCBI SRA http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/SRX019000

鎖鋸 http://g86.dbcls.jp/kusarinoko/result#SRA012435

などにある、当該シーケンスを使った元論文のPubMed IDへのリンク

Population genomic sequencing of Coccidioides fungi reveals recent hybridization and transposon control. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20516208

が間違いで、

Allele-specific methylation is prevalent and is contributed by CpG-SNPs in the human genome. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20418490

が正解なように見えます。

質問日 Jul 30 '13 at 19:38

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nob_fj ♦
50761328


こういうのがありましたら、どんどんHelp desk に聞いてみるのがよいと思います。 (以下のリンクでは、左下に Write to the Help Desk とある。) http://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/?study=SRP002280

SRAの登録に関しては sra at ncbi.nlm.nih.gov、 GEOの登録に関しては、geo at ncbi.nlm.nih.gov です。 論文が公開されたのに、データがロックされている場合など、 メールを書くとすぐに対応してくれています。 こちらからもメールを出しておきました。 (30minほどで修正がはいりました。)

回答日 Jul 31 '13 at 00:40

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mtothen
664

edited Sep 10 '13 at 22:16

mn3's gravatar image

mn3 ♦♦
5154922

NCBIにご連絡までいただいたようで、ありがとうございます。もう対応されており、驚いております!! 意外とすぐに対応されるようで、今後は見つけたらhelp deskまで問合せしたいと思います。

(Jul 31 '13 at 15:12) nob_fj ♦ nob_fj's gravatar image
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質問日: Jul 30 '13 at 19:38

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最終更新日: Sep 10 '13 at 22:16

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