ログイン 概要 よくある質問

NCBIなどに蓄積している癌のゲノムデータベースに対してある特別な配列(人にはない配列です)のインテグレーションを調べたいと考えています。 出来ればすべての癌に対して調べたいのですが、 難しいなら特定の癌腫に限定しようと思っています。 どのような手順を踏むのが最短でできますでしょうか? 全てのゲノム配列をダウンロードするのは、かなり大変な作業だと思いますが、ダウンロードする他ないでしょうか? 事前の予想では、予めalignmentの取られている配列だと、除外されているのではと考えていますが、現段階では分かりません。

上記の質問は具体的ではなかったので、変更させていただきます。 https://cghub.ucsc.edu/ 上記よりゲノムデータをダウンロードして、Blast等でサーチできる環境を作りたいのですが、具体的にどのような手順を踏むのがベストでしょうか?

質問日 Oct 17 '15 at 20:01

Hiroya's gravatar image

Hiroya
11

edited Oct 20 '15 at 17:40

この質問の最初の回答者になりましょう!
プレビューをトグルする

この質問をフォローする

By Email:

Once you sign in you will be able to subscribe for any updates here

By RSS:

回答

回答とコメント

タグ:

×1

質問日: Oct 17 '15 at 20:01

閲覧数: 974 回

最終更新日: Oct 20 '15 at 17:40

関係した質問

powered by OSQA