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Native vendor file の情報を画像以外すべて保存したSRA-full形式にくらべFastQファイルだけならDDBJ調査で総サイズは29%ですみます。 コストを考えるとFastQじゃできないことがないといけません。

<補足:DDBJ>この質問の意図は、DRA継続に際してサイズダウンで良いかをユーザの皆様に問う事です。 現在SRA-Lite形式もサポートしておりますが、FASTQ形式だけで問題ないでしょうか?(でしたらコスト安で済みます)。 DRAの運営に際して、次世代シークエンサ利用者の皆様から御意見を頂けますと助かります。宜しくお願い致します。

質問日 Feb 25 '11 at 15:40

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okubo
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edited Feb 25 '11 at 22:23

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ma_ko ♦♦
3711312


昔のゲルファイルはトラック間違ってることがありでっかい画像ファイルをMOにためてました。トラックのやり直しをすることもたまにあったと思います。 こんな風なことは新型はないのでしょうか?? たとえば http://www.oxfordjournals.org/our_journals/bioinformatics/nextgenerationsequencing.html ここには FastQ以外を使うapplication はありますか?

回答日 Feb 25 '11 at 18:50

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okubo
1315913

edited Feb 28 '11 at 14:44

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質問日: Feb 25 '11 at 15:40

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最終更新日: Feb 28 '11 at 14:44

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