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いつも大変お世話になっております。
Ensemblのtranscripts idについてお伺いしたいのですが、
ENST00000254657.3のようにドット3が付いているのは、
isoformのtranscriptsが何らかの要因で3回情報が更新されている、
といった意味だとうろ覚えの記憶があるのですがお詳しいかたいらっしゃいますでしょうか。
ご回答、どうぞよろしくお願い申し上げます。

suimye

質問日 May 10 '13 at 18:28

suimye's gravatar image

suimye
2961815


ENST00000254657 ページのTranscript Hitosyに過去のバージョンから変遷のヒストリがあります。これをみると、ドット以下の数値はシリアルになっているようです。アセンブルの変化に伴って、三つのトランスクリプトが関係していることがわかります。Transcript HistoryページのID Historyのヘルプのリンクに直接的ではありませんが解説がありました。

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回答日 May 11 '13 at 13:17

mn3's gravatar image

mn3 ♦♦
5154922

mn3様
ご回答ありがとうございました。
さっそくTranscript Histroyを拝見いたしました
面白い! シリアルがどうなったのかが
assemblyのバージョンに従って、時系列的に分かるんですね!
また、自分が扱ってるAnnotation dataが古い場合、シリアルが最新かどうかなどの
確認にも使えそうです。とても参考になりました。ありがとうございました。
Suimye

(May 12 '13 at 10:32) suimye suimye's gravatar image
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質問日: May 10 '13 at 18:28

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最終更新日: May 12 '13 at 10:50

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