http://qa.lifesciencedb.jp/questions/227/c-value-%E3%81%8B%E3%82%89%E3%82%B2%E3%83%8E%E3%83%A0%E3%82%B5%E3%82%A4%E3%82%BA%E3%82%92%E6%8E%A8%E5%AE%9A%E3%81%99%E3%82%8B<p>C-value からゲノムサイズへ変換するための式を，wikipedia に見つけました。</p> <blockquote> <p>the mean weight of one nucleotide pair would be 1.0855× 1e-9 pg, and 1 pg of DNA would represent 0.921 × 1e+9 base pairs.（http://en.wikipedia.org/wiki/C-value）</p> <p>genome size (bp) = (0.921 x 1e+9) x DNA content (pg)（http://en.wikipedia.org/wiki/C-value）</p> </blockquote> <p>この式ですが，二倍体生物については，下記のような式だと思います。</p> <blockquote> <p>(haploid) genome size (bp) = (0.921 x 1e+9) x DNA content (pg) / 2</p> <p>diploid genome size (bp) = (0.921 x 1e+9) x DNA content (pg) </p> </blockquote> <p>Wikipedia によると，ヒトの女性の C-value は，6.950 pg だそうです。</p> <blockquote> <p>diploid human female and male nuclei in G1 phase of the cell cycle should contain 6.950 and 6.829 pg of DNA, respectively.（http://en.wikipedia.org/wiki/C-value）</p> </blockquote> <p>このデータを上式に代入すると，</p> <blockquote> <p>haploid genome size (bp) = (0.921 x 1e+9) x 6.950 / 2 = 3.2 Gbp</p> </blockquote> <p>となり，推定値としては悪くない結果になります。</p> <p>・・・と，素人なりに頑張って考えてみたのですが，上のような考え方で間違っていないでしょうか？ 詳しい方がいましたら，教えていただけると嬉しいです。</p>jaMon, 22 May 2023 18:35:15 -0000