Answers to: 次世代シーケンサーにおけるcoverageの日本語訳

Answer by ksukeiida

ksukeiida — Thu, 13 Jan 2011 22:10:31 +0900

「カバー率」と日本語にします．みるかぎり，それが一番多いように思います．まあ，日本語としてもわかりやすいですし．

Answer by 38brain

38brain — Thu, 13 Jan 2011 17:57:38 +0900

被覆率（ひふくりつ）じゃないでしょうか。時々シーケンサーの分野で耳にします。
でも、genome coverageまたはゲノムのカバー率と言ってくれた方が意味はわかりやすいですけど（笑）。
以下参照：
http://ibisforest.org/index.php?被覆率

追記：
「(read) depth of coverage」は被覆されている領域の（読み）深度（読まれた回数）ですよね。
論文上で通常は平均のdepth of coverageが示されている場合が多いと思いますが。
なので厳密には「coverage」と単独で書いている場合と「depth of coverage」と書いている場合とでは意味は異なると思います。

追記２：
ma_koさんがおっしゃるように論文上では日本語の『率（％）』ではなくdepth of coverageの意で使われていることがほとんどのようですね。
depth of coverageまたはcoverage depthと書いてくれている場合も少なくないようですが、単にcoverageのみと書いている場合でも意味はほとんど読み深度（depth）の意味のようです。（次世代シーケンサー関連の論文では。）
日本語にする場合は論文上での意味合いを確認しつつ、率（%）の意味でないと判断できれば「read depth（リードデプス）」または「読み深度」と変換して伝えるのが（聞く人・見る人の）勘違いを避けるためには良さそうですね。

Answer by ma_ko

ma_ko — Thu, 13 Jan 2011 17:51:40 +0900

僕の知る限り、depth と coverage は同じ意味で、僕は紛らわしくないように depth を好んで使っています。
http://biostar.stackexchange.com/questions/638/what-is-the-sequencing-depth http://en.wikipedia.org/wiki/Shotgun_sequencing#Coverage

日本語だと冗長度なんですかね? やはり depth と表すのをオススメします。

[追記]
NGS の文脈だとほとんどの場合 "(depth of) coverage" なので、
日本語のカバー率 (その領域をどれくらいシーケンス出来ているか)
とはニュアンスの違うもの、というのが僕の理解です。

[追記]
僕は率と訳出するのに反対です。
理由は、日本語の率は% (パーセンテージ) を連想させますが、この質問での Coverage は率 (パーセンテージ) を指していないと理解しているからです。上で示した Wikipedia でも1塩基あたり何度読まれているか、を Coverage だとしています。
逆に率に相当する文脈は英語では Covered だと理解しています。
僕の知識が Exome / Target resequence に偏っているからかもしれませんが、多くの論文では以下に示すように Coverage は depth of coverage そのもののことで 何度読まれているか (10X、40Xなど)に対応していて、対象とした領域をシークエンスできた率は Covered が対応しているという印象を持っています。
(しつこくてすいません…)
https://skitch.com/mako/rjj8n/re-nature09327-s1.pdf-14-1750-84
https://skitch.com/mako/rjjb5/gb-2010-11-6-r62.pdf-3-850-84
https://skitch.com/mako/rjjb2/ng.653-s1.pdf-12-1550-84
https://skitch.com/mako/rjrwc/www.nejm.org-doi-pdf-10.1056-nejmoa1002926

Answer by inutano

inutano — Thu, 13 Jan 2011 17:49:42 +0900

「建蔽率」が、coverageの訳語として挙げられていますよ。 http://ja.bab.la/辞書/日本語-英語/建蔽率

でも、そう呼んでいるのを聞いたことはないです…。

Answer by hub

hub — Thu, 13 Jan 2011 17:46:55 +0900

「カバー率」はいかがですか？