http://qa.lifesciencedb.jp/questions/278/galaxy%E3%81%AE%E3%83%92%E3%82%B9%E3%83%88%E3%83%AA%E3%83%BC%E3%81%A7%E5%89%8A%E9%99%A4%E3%81%97%E3%81%9F%E3%83%87%E3%83%BC%E3%82%BF%E3%82%92%E5%AE%8C%E5%85%A8%E3%81%AB-hdd%E3%81%8B%E3%82%89-%E5%89%8A%E9%99%A4%E3%81%99%E3%82%8B%E6%96%B9%E6%B3%95%E3%82%92%E6%95%99%E3%81%88%E3%81%A6%E3%81%8F%E3%81%A0%E3%81%95%E3%81%84<p>Galaxyを手元の環境に構築してデータ解析の準備をしています。</p> <p>こちらのサイトの情報も参考にさせていただいております。ありがとうございます。</p> <p>データの登録・解析をして実験しているのですが、 削除したデータをHDD上から消す方法が分からず困っております。</p> <p>ヒストリーから削除したデータは削除扱いになるだけで、HDD（**<em>/database/files/000/dataset_</em>.dat)にはデータが残ったままです。</p> <p>もちろん rmコマンドで削除すれば消えるのですが、Galaxyから（またはGalaxy管理ツール？から）削除する方法がわかりません。</p> <p>どなたか削除方法をご存知の方はいらっしゃいますでしょうか。</p>jaFri, 21 Jan 2011 18:30:37 +0900http://qa.lifesciencedb.jp/questions/278/galaxy%E3%81%AE%E3%83%92%E3%82%B9%E3%83%88%E3%83%AA%E3%83%BC%E3%81%A7%E5%89%8A%E9%99%A4%E3%81%97%E3%81%9F%E3%83%87%E3%83%BC%E3%82%BF%E3%82%92%E5%AE%8C%E5%85%A8%E3%81%AB-hdd%E3%81%8B%E3%82%89-%E5%89%8A%E9%99%A4%E3%81%99%E3%82%8B%E6%96%B9%E6%B3%95%E3%82%92%E6%95%99%E3%81%88%E3%81%A6%E3%81%8F%E3%81%A0%E3%81%95%E3%81%84/283<p>自己解決しました。</p> <p>*/scripts/cleanup_datasets/ のスクリプトによってデータ削除を行うことができました。</p> <p>削除の手順</p> <ol> <li> <p>"history"の削除対象となるデータを"×"で削除する。</p> </li> <li> <p>delete＿datasets.sh を実行する。　(※シェルスクリプト内の-d 指定日数より前に 1. を行ったデータに対してdataset.deleted=1にする。　また対象のmetadata＿fileが消える)</p> </li> <li> <p>purge＿datasets.sh を実行する。　(※シェルスクリプト内の-d 指定日数より前に 2. を行ったデータに対してdatasetのファイルを削除する)</p> </li> </ol> <p>2,3を連続して実行する場合は、3の -dの指定は 0でよいです。</p>TsukaharaFri, 21 Jan 2011 18:30:37 +0900http://qa.lifesciencedb.jp/questions/278/galaxy%E3%81%AE%E3%83%92%E3%82%B9%E3%83%88%E3%83%AA%E3%83%BC%E3%81%A7%E5%89%8A%E9%99%A4%E3%81%97%E3%81%9F%E3%83%87%E3%83%BC%E3%82%BF%E3%82%92%E5%AE%8C%E5%85%A8%E3%81%AB-hdd%E3%81%8B%E3%82%89-%E5%89%8A%E9%99%A4%E3%81%99%E3%82%8B%E6%96%B9%E6%B3%95%E3%82%92%E6%95%99%E3%81%88%E3%81%A6%E3%81%8F%E3%81%A0%E3%81%95%E3%81%84/283