http://qa.lifesciencedb.jp/questions/359/%E6%96%B0%E5%9E%8B%E3%82%B7%E3%83%BC%E3%82%B1%E3%83%B3%E3%82%B5%E3%83%BC%E3%81%AE%E7%94%9F%E3%83%87%E3%83%BC%E3%82%BF%E3%81%AF%E4%BD%95%E5%B9%B4%E4%BF%9D%E5%AD%98%E3%81%99%E3%82%8B%E3%81%B9%E3%81%8D%E3%81%A7%E3%81%97%E3%82%87%E3%81%86%E3%81%8B<p>ディスクスペースを節約するのに古いもの使われなかったものを破棄する　超整理法的な態度もあります。テープに書き出すのもままならない大量のアーカイブは新ディスクへと継代でmigrateさせて維持すべきでしょうか？</p>jaSat, 14 May 2011 02:08:30 +0900http://qa.lifesciencedb.jp/questions/359/%E6%96%B0%E5%9E%8B%E3%82%B7%E3%83%BC%E3%82%B1%E3%83%B3%E3%82%B5%E3%83%BC%E3%81%AE%E7%94%9F%E3%83%87%E3%83%BC%E3%82%BF%E3%81%AF%E4%BD%95%E5%B9%B4%E4%BF%9D%E5%AD%98%E3%81%99%E3%82%8B%E3%81%B9%E3%81%8D%E3%81%A7%E3%81%97%E3%82%87%E3%81%86%E3%81%8B/441<p>ボクは，NGS生データ（画像データ）は必ずしも保存しておく必要はないと思っています。 Illumina GAIIx の制御プログラムは，SCS2.8/RTA1.8 のバージョンへ移行した際に，（推奨パラメータでは）120タイル/レーンのうち 20 タイル（もっと少なかったかも）の画像だけ保存し，それ以外の画像は intensity ファイルを作成した段階で破棄するようになりました。データの書き込み速度が，シーケンスのスピードに追いつかないための仕様変更と聞いています。</p> <p>果たして画像データに，シーケンススループットを代償にするだけの価値はあるだろうか？ という判断の問題かと思いますが，ボクらはシーケンススループットを重視し，全ての画像データは保存していません。 （後々シーケンスの失敗が起きてないか検証する目的で，数タイル分の画像データだけを保存しています。）</p> <p>同様に，ハードディスク自体のコスト，それらハードディスクの保管のコストと，画像データのトレードオフもありますよね。 ボクらの他にも，日本を代表するようなシーケンスセンターでも画像データを破棄していると聞きますし，「絶対に破棄してはいけない」というものではなく，トレードオフを考えて，それぞれの判断をすれば良いように思います。</p>hacchySat, 14 May 2011 02:08:30 +0900http://qa.lifesciencedb.jp/questions/359/%E6%96%B0%E5%9E%8B%E3%82%B7%E3%83%BC%E3%82%B1%E3%83%B3%E3%82%B5%E3%83%BC%E3%81%AE%E7%94%9F%E3%83%87%E3%83%BC%E3%82%BF%E3%81%AF%E4%BD%95%E5%B9%B4%E4%BF%9D%E5%AD%98%E3%81%99%E3%82%8B%E3%81%B9%E3%81%8D%E3%81%A7%E3%81%97%E3%82%87%E3%81%86%E3%81%8B/441http://qa.lifesciencedb.jp/questions/359/%E6%96%B0%E5%9E%8B%E3%82%B7%E3%83%BC%E3%82%B1%E3%83%B3%E3%82%B5%E3%83%BC%E3%81%AE%E7%94%9F%E3%83%87%E3%83%BC%E3%82%BF%E3%81%AF%E4%BD%95%E5%B9%B4%E4%BF%9D%E5%AD%98%E3%81%99%E3%82%8B%E3%81%B9%E3%81%8D%E3%81%A7%E3%81%97%E3%82%87%E3%81%86%E3%81%8B#365<p>米国では科学データを１００年間保存するという方針ということを聞いた事があります。その経緯や議論が論点の一つになると考えます。そのために、これらのソース（法律名や記載されているサイトのURLなど）についてご存知でしたら、質問文に加えていただければと思います。</p>mn3Fri, 25 Feb 2011 19:29:10 +0900http://qa.lifesciencedb.jp/questions/359/%E6%96%B0%E5%9E%8B%E3%82%B7%E3%83%BC%E3%82%B1%E3%83%B3%E3%82%B5%E3%83%BC%E3%81%AE%E7%94%9F%E3%83%87%E3%83%BC%E3%82%BF%E3%81%AF%E4%BD%95%E5%B9%B4%E4%BF%9D%E5%AD%98%E3%81%99%E3%82%8B%E3%81%B9%E3%81%8D%E3%81%A7%E3%81%97%E3%82%87%E3%81%86%E3%81%8B#365http://qa.lifesciencedb.jp/questions/359/%E6%96%B0%E5%9E%8B%E3%82%B7%E3%83%BC%E3%82%B1%E3%83%B3%E3%82%B5%E3%83%BC%E3%81%AE%E7%94%9F%E3%83%87%E3%83%BC%E3%82%BF%E3%81%AF%E4%BD%95%E5%B9%B4%E4%BF%9D%E5%AD%98%E3%81%99%E3%82%8B%E3%81%B9%E3%81%8D%E3%81%A7%E3%81%97%E3%82%87%E3%81%86%E3%81%8B/362<p>これも、破棄は考えず、可能な限り、長期間保存すべきと考えます。 すみお</p>okuboFri, 25 Feb 2011 17:50:47 +0900http://qa.lifesciencedb.jp/questions/359/%E6%96%B0%E5%9E%8B%E3%82%B7%E3%83%BC%E3%82%B1%E3%83%B3%E3%82%B5%E3%83%BC%E3%81%AE%E7%94%9F%E3%83%87%E3%83%BC%E3%82%BF%E3%81%AF%E4%BD%95%E5%B9%B4%E4%BF%9D%E5%AD%98%E3%81%99%E3%82%8B%E3%81%B9%E3%81%8D%E3%81%A7%E3%81%97%E3%82%87%E3%81%86%E3%81%8B/362