Answers to: consedでadd_newするときのエラーの件

Answer by tt

tt — Tue, 12 Jul 2011 17:49:05 +0900

つまらないことですが、上位のフォルダ名に（）がみつかったので除去したら正常に動くようになりました。お騒がせしました。

tt — Wed, 06 Jul 2011 23:52:45 +0900

どうもありがとうございます。他にも例があることがわかり、少し安心しました。サーバーを変えてやってみたらふつうにできました。両方ともconsed20ですが何が違うのかまでは、よくわかりませんでした。

mya_ — Fri, 17 Jun 2011 23:59:50 +0900

consed19で似たような症状が出ているのがSeqAnswersに出ていました。入力シーケンス名に空白が含まれている場合は修正するか、もしくは最新版のconsed20を試されてみるのはどうでしょう。

tt — Fri, 17 Jun 2011 19:19:54 +0900

一度コンセンサスをマルチファスタに書き出してから、fasta2Aceをしてもうまくいっておりません。

tt — Fri, 17 Jun 2011 19:14:43 +0900

consedのテストデータでは問題なく動作しています。