http://qa.lifesciencedb.jp/questions/800/twobittofa-command-not-found<p>いつもお世話になっております。 Mac OSX 10.9.5 のターミナルを使用し、NGS解析に取り組んでおります。</p> <p>UCSC からマウスゲノム（mm10）のデータを取得するため、mm10.2bit をダウンロードしました。 勉強ののち、twoBitToFa を取得し、PATH を通しました（$ echo $PATH で確認）。なお、$ ./twoBitToFa を実行すると、usage などが表示されます。</p> <p>ところが、いざ2bit ファイルをfasta ファイルに変換するため、$ twoBitToFa mm10.2bit mm10.fa を実行しても、 command not found となって実行できません。 SEQansewers も読みながら試行錯誤してますが、解決できません。</p> <p>なお、$ uname -ps　を実行すると、Darwin i386 と表示されます。 また、$ file twoBitToFa を実行すると、twoBitToFa: Mach-O 64-bit executable x86_64 と表示されます。</p> <p>試行錯誤の次の一手が打てず、往生しております。 どなたかご教授頂けませんでしょうか？ お手数をおかけ致しますが、どうか宜しくお願い致します。</p>jaFri, 07 Nov 2014 09:28:53 +0900http://qa.lifesciencedb.jp/questions/800/twobittofa-command-not-found/801<p>質問者です。お騒がせして申し訳ございません。知人より、indexしたmm10 配列を入手致しました。実は、現在の環境ではftpサーバーにアクセスできないため、2bit ファイルからの変換を試みていた次第です。結局、ファイル変換は出来ませんでしたが、閲覧して頂いた皆様方に厚く御礼申し上げます。本掲示板にはまたすぐにお世話になるかと思います。いつも本当にありがとうございます。敬具</p>araFri, 07 Nov 2014 09:28:53 +0900http://qa.lifesciencedb.jp/questions/800/twobittofa-command-not-found/801