consedでadd_newするときのエラーの件

皆様こんにちは

consedでnewblerの出力データに対し,add newしたいのですが、エラー番号５１２というのが出てしまい、うまくいきません。どうしたらいいでしょうか。

add_new

質問日 Jun 17 '11 at 16:40

tt
16●1●2

consedのテストデータでは問題なく動作しています。

(Jun 17 '11 at 19:14) tt

一度コンセンサスをマルチファスタに書き出してから、fasta2Aceをしてもうまくいっておりません。

(Jun 17 '11 at 19:19) tt

2 Answers:

0	つまらないことですが、上位のフォルダ名に（）がみつかったので除去したら正常に動くようになりました。お騒がせしました。回答日 Jul 12 '11 at 17:49 tt 16●1●2

consed19で似たような症状が出ているのがSeqAnswersに出ていました。入力シーケンス名に空白が含まれている場合は修正するか、もしくは最新版のconsed20を試されてみるのはどうでしょう。

回答日 Jun 17 '11 at 23:59

mya_ ♦
388●1●10●14

どうもありがとうございます。他にも例があることがわかり、少し安心しました。サーバーを変えてやってみたらふつうにできました。両方ともconsed20ですが何が違うのかまでは、よくわかりませんでした。

(Jul 06 '11 at 23:52) tt

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質問日: Jun 17 '11 at 16:40

閲覧数: 2,758 回

最終更新日: Jul 12 '11 at 17:49

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