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ChEMBLを利用していますが、化合物情報をsdf形式でダウンロードするにはどうすればいいのでしょうか？ 例) CHEMBL1134744 Bioorg. Med. Chem. Lett. (2001) 11:2951-2954 |
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Compound Summaries セクションの各チャートの右側にメニューがあり、そこから操作するとSDFをダウンロードできます。
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題意に沿わないかもしれませんが、 ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/chembl/ChEMBLdb/releases/chembl_14/ から、chembl_14.sdf.gzを取得するとか NCBI pubchemでSOURCEとしてChEMBLで検索しSDFをダウンロードすることが できます。後者のほうは正確ではないかもしれませんが複数のSOURCEのAND/ORが できるので重宝しています。 |
