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ディスクスペースを節約するのに古いもの使われなかったものを破棄する 超整理法的な態度もあります。テープに書き出すのもままならない大量のアーカイブは新ディスクへと継代でmigrateさせて維持すべきでしょうか？ |
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ボクは，NGS生データ（画像データ）は必ずしも保存しておく必要はないと思っています。 Illumina GAIIx の制御プログラムは，SCS2.8/RTA1.8 のバージョンへ移行した際に，（推奨パラメータでは）120タイル/レーンのうち 20 タイル（もっと少なかったかも）の画像だけ保存し，それ以外の画像は intensity ファイルを作成した段階で破棄するようになりました。データの書き込み速度が，シーケンスのスピードに追いつかないための仕様変更と聞いています。 果たして画像データに，シーケンススループットを代償にするだけの価値はあるだろうか？ という判断の問題かと思いますが，ボクらはシーケンススループットを重視し，全ての画像データは保存していません。 （後々シーケンスの失敗が起きてないか検証する目的で，数タイル分の画像データだけを保存しています。） 同様に，ハードディスク自体のコスト，それらハードディスクの保管のコストと，画像データのトレードオフもありますよね。 ボクらの他にも，日本を代表するようなシーケンスセンターでも画像データを破棄していると聞きますし，「絶対に破棄してはいけない」というものではなく，トレードオフを考えて，それぞれの判断をすれば良いように思います。 |
米国では科学データを１００年間保存するという方針ということを聞いた事があります。その経緯や議論が論点の一つになると考えます。そのために、これらのソース（法律名や記載されているサイトのURLなど）についてご存知でしたら、質問文に加えていただければと思います。