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illuminaシーケンスのライブラリを作成する場合、paired-endとmate-pairの２種類の作成方法があるようですが、 これら２種類のライブラリが混在しているシーケンス群が存在していたとして、補足情報無しで素のシーケンスデータのみでシーケンス仕分けできる方法がありましたら教えて下さい。 novoalignのように、mapping状況から推測して仕分けるのではなく、解析にかける前処理として仕分けがしたい、というのが目的です。 Paired End ライブラリの場合: http://www.illumina.com/systems/genome_analyzer/paired_end_module.ilmn ---[read1]--->(insert)<===[read2]===Mate Pair ライブラリの場合: http://www.illumina.com/technology/mate_pair_sequencing_assay.ilmn <===[read2]===(long insert)---[read1]---> 参考にしたページ: |
