ド素人の質問申し訳ありません。 manualを読みながらtrans-ABySSをインストールしようとしているのですが、 setupするまでがよくわかりません。 pythonは最新ver.をインストールして、Perlはmacなのかv5.10.0がもともと入ってPATHも加えてありました。 そこでmanual通り export TRANSABYSS_PATH=/home/user/Desktop/trans-ABySS export PYTHONPATH=.:$PYTHONPATH:$TRANSABYSS_PATH export PERL5LIB=.:$PERL5LIB:$TRANSABYSS_PATH/wrappers をやった後にsetupしたのですがPermission deniedとなってしまいます。 どなたかご助言いただけると、幸いです。 よろしくお願いします。 質問日 Jun 12 '11 at 18:37 pan |
macユーザでないので確証はありませんが、 permission deniedは権限の無いユーザーでコマンドを実行した際に出るUNIX/LINUX系の メッセージと同じだと思うので、権限のあるユーザ(rootとか)で再実行するか、 sudo export.. としてはどうでしょう。"mac permission denied"でgoogle検索などすれば、 関係ありそうな文章はたくさん出てくる気がします。 回答日 Jun 14 '11 at 13:09 nob_fj ♦ お返事ありがとうございます。 permission deniedは解決したのですが、今度はノーリアクションで実行できません。 おそらくPATHの設定が悪いのではないかと思います。pythonもPerlインストールしたら PATHの設定されているので必要ない?のでmunualの意味がよくわかりません。 どのファイルをPATH設定したらようのでしょうか??
(Jun 15 '11 at 16:29)
pan
version1.2のパッケージの中身を見てみていますが、 trans-ABySS-v1.2.0.tar/trans-ABySS/README に書いてある EXTERNAL SOFTWARE DEPENDENCIES に記載のある以下のツール群はインストール済みですか?結構前提を満たす自体がハードなツールという印象ですが。
(Jun 15 '11 at 19:21)
nob_fj ♦
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